El 23 de junio de 1870, los franciscanos Fray Bernardo Arana y Fray Gerónimo Marchetti fundaron la reducción “Nuestra Señora de la Soledad”, también llamado pueblo de San Martín. Esta localidad nace de un intento de los franciscanos de colonizar y desarrollar la agricultura a partir de los pueblos originarios.
Desde los inicios estuvo presente la idea de edificar una construcción religiosa que respondiera al espíritu evangelizador de los padres franciscano. Fue así que la construcción comenzó en 1891, siendo bendecida la obra el 10 de mayo de 1896.
Durante muchos años este lugar fue el centro de operaciones de la congregación franciscana, que llevó a cabo una importante obra en toda la zona. Los frailes, en especial, Fray Buenaventura Giuliani, fueron los precursores y gestores del progreso de la región. Tuvieron que ver no sólo en la evangelización, sino que también desarrollaron funciones relacionadas con la salud, la educación y la cultura del trabajo. En instalaciones anexas al templo, funcionó, por muchos años, un seminario franciscano.
